Shafer Vineyards werd opgericht in 1972, toen John Shafer, na een succesvolle carrière in de uitgeverswereld, samen met zijn zoon Doug, wijngaarden kocht aan de Silverado Trail in Napa Valley. Ze kochten 84 ha, waarvan 12 beplant met wijnstokken. Direct werd een programma van bij- en herbeplanting uitgevoerd. Vanaf hun start zijn de Shafers zeer innovatief te werk gegaan. Doel was uit te komen bij een volstrekt natuurlijke manier van druiventeelt en wijn maken. Door het laten groeien van o.a. klaver en erwten, die naast het tegengaan van erosie ook een rijke humuslaag vormen, worden bijen en andere insecten aangetrokken die zorgen voor een optimale bestuiving en een natuurlijk leefmilieu. Het gebruik van pesticiden kan daardoor voorkomen worden. Tegenwoordig bezit Shafer 80 ha wijngaard in de beste gedeelte van Napa Valley en heeft zeer beperkt een aantal langdurige overeenkomsten met eigenaars van een paar wijngaarden. Shafer heeft wijngaarden in verschillende AVA’s van Napa Valley zoals het beroemde Stags Leap District rondom de winery, Yountville en wijngaarden in de heuvels richting de oostelijk gelegen Vaca Mountains. Wijnmaker Elias Fernandez is sinds 1994 werkzaam bij Shafer en wordt gezien als één van de meest getalenteerde wijnmakers in Napa. Sinds 2004 is Shafer het eerste bedrijf in Napa dat volledig zelfvoorzienend is in de energiebehoefte door de plaatsing van zonnepanelen op de winery. Al het benodigde water wordt gerecycled en voor de druppelirrigatie gebruikt Shafer een ingenieus systeem dat meet hoeveel water een stok echt nodig heeft. Productie bedraagt ongeveer 360.000 flessen per jaar en Shafer staat al jaren bekend als een icoon-winery met een goede distributie world wide.